ДНК пустынных генов связывают с раком груди
Даже длинные участки ДНК, не содержащие гены, могут оказывать влияние на риск развития рака груди посредством физического взаимодействия с генами в целом, как сообщает новое исследование.
Ученые из Института онкологических исследований в Лондоне обнаружили, что вариации единственной буквы внутри так называемых генных пустынь повышают риск развития рака груди, поскольку нарушают активность других генов.
Исследование, результаты которого были опубликованы в журнале Genome Research, помогает объяснить то, как Пустые ДНК в действительности могут играть важную роль относительно человеческого здоровья и заболеваний. Исследование было профинансировано организациями Breakthrough Breast Cancer, Cancer Research UK, Breast Cancer Campaign и Medical Research Council.
Чуть ранее приблизительно 70 вариантов единых букв были связаны с раком груди. Женщины с необычным буквенным ДНК-кодом в любой вариационной точке более склонны к развитию данного онкологического заболевания, несмотря на то, что все эти вариации по отдельности могут лишь ненамного повышать риск. Большая часть из них отмечена в некодирующем участке ДНК.
В своем исследовании ученые применили инновационную технологию, известную как Capture HiC, чтобы иметь возможность сконцентрировать внимание на трех пустынных генах, каждый из которых имел одну из вариаций. Такая технология позволяет выделать физическое взаимодействие регионов ДНК, оказалась способна идентифицировать места, где пустынные ДНК-участки с наибольшей вероятностью будут сцеплены с другими ДНК-регионами, включая известны к настоящему времени гены рака груди.
Для одного региона ученые смогли показать то, что специфическая буквенная вариация была непосредственно вовлечена во взаимодействие с последовательностью ДНК, которая регулирует функции гена со множественными клеточными эффектами. так называемый полиморфизм нарушате физическое соединение мехду участком ДНК в пустынном гене и другой секцией рядом с геном IGFBP5, который, согласно мнению ученых может играть роль в развитии рака груди.