Лечение онкологии » Новости » Слепые пятна в ДНК могут маскировать раковые гены

Слепые пятна в ДНК могут маскировать раковые гены

Несмотря на то, что технология чтения генов в настоящее время является достаточно продвинутой, все же существуют определенные участки ДНК, с которыми до сих пор трудно работать; в частности, существуют повторяющиеся участки ДНК, которые являются причиной приостановления ДНК-машинерии.

Однако, по мнению ученых, все же у них есть возможность изучить такие слепые участки и открыть, не маскируют ли они раковые гены. Исследователи воспользовались двумя крупными базами раковых генов данных для определения таких слепых участков в ДНК, которые могут содержать гены, вызывающие развитие раковых заболеваний.

Таково было заключение нового исследования ученых из Университета Манчестера, чьи результаты были опубликованы в журнале Cancer Research.

Исследователи обнаружили более 400 слепых участков ДНК, которые могут содержать гены, ведущие к развитию онкологических заболеваний. Как поясняет ведущий исследователь, докор Эндрю Хадсон, раковые гены имеют свою историю, несмотря на то, что ученые могут прочитать большую их часть при помощи современных технологий, все же ограничения в применении существующих генетических инструментов ведут к возникновению неизученных областей.

Такие слепые участки могут содержать и маловажную информацию, однако, в это же время они могут быть заполнены и важной информацией, которая может помочь в понимании рака. В дальнайшем исследователи планируют более тщательное изучение данных слепых участков.

Для своей исследования ученые сравнили две крупные базы данных геномного секвенирования в области онкологических генов, результаты которых были получены при изучении раковых клеток, выращенных в лаборатории; далее ученые перекрестно проверили все гены, которые могут быть вовлечены в развитие раковых заболеваний. Такими базами данных являются Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) и Catalogue of Somatic Mutations in Cancer (CSMIC).

По их утверждению проведенный анализ выявил определенные неполадки в определении мутаций в идентичных клеточных линиях (57,38% подобия); также было отмечено, что основной причиной таких неполадок является неадекватное секвенирование GC-участков ДНК.